改组后的中关村科技公司由鹏泰投资、粤文音像、海源控股三家民营公司与中关村高科技产业促进中心、北京实创高科技发展总公司、北京北大方正集团有限公司等国有股东共同控制大部分非流通股股权。中关村科技公司自此由一个国有控股的上市公司转变为多种经营成分的新型现代企业制度的股份制公司。
公司新任董事长许钟民坦言，公司目前还有银行债务数额大、财务负担沉重等困难。最为股民关心的CDMA项目的33亿元担保问题，将于2007 年底予以解决。随着公司重组完成，企业性质发生重大变化，公司法人治理结构将更加科学，高管团队也更精简干练。2007年，公司将从过去的强调市场占有率、不重视收益，转向先做强、再做大，努力为股东带来良好收益。
拥有众多中小股民的中关村科技公司是一家社会关注的大型上市企业，由于初创期投资项目过多而造成前几年连续亏损。2005年底开始，公司启动重组股改工作，期间几经波折，于2007年1月11日结束。据介绍，2006年公司经营管理工作正常进行，预计可实现净利润在1000万元至1500万元之间。
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