导致系统无法正常运行的最可能的原因是磁盘已满。一个好的网络管理员会密切关注磁盘的使用情况，隔一定的时间，就需要将磁盘上的一些负载转存到备份存储介质中（例如磁带）。
日志文件会很快用光所有的磁盘空间。Web服务器的日志文件、SQL*Net的日志文件、JDBC日志文件，以及应用程序服务器日志文件均与内存泄漏有同等的危害。可以采取措施将日志文件保存在与操作系统不同的文件系统中。日志文件系统空间已满时Web服务器也会被挂起，但机器自身被挂起的几率已大大减低。
C指针错误
用C或C++编写的程序，如Web服务器API模块，有可能导致系统的崩溃，因为只要间接引用指针（即，访问指向的内存）中出现一个错误，就会导致操作系统终止所有程序。另外，使用了糟糕的C指针的Java模拟量（analog）将访问一个空的对象引用。Java中的空引用通常不会导致立刻退出JVM，但是前提是程序员能够使用异常处理方法恰当地处理错误。在这方面，Java无需过多的关注，但使用 Java对可靠性进行额外的度量则会对性能产生一些负面影响。
内存泄漏
C/C++程序还可能产生另一个指针问题：丢失对已分配内存的引用。当内存是在子程序中被分配时，通常会出现这种问题，其结果是程序从子程序中返回时不会释放内存。如此一来，对已分配的内存的引用就会丢失，只要操作系统还在运行中，则进程就会一直使用该内存。这样的结果是，曾占用更多的内存的程序会降低系统性能，直到机器完全停止工作，才会完全清空内存。
解决方案之一是使用代码分析工具（如Purify）对代码进行仔细分析，以找出可能出现的泄漏问题。但这种方法无法找到由其他原因引起的库中的泄漏，因为库的源代码是不可用的。另一种方法是每隔一段时间，就清除并重启进程。Apache的Web服务器就会因这个原因创建和清除子进程。
虽然Java本身并无指针，但总的说来，与C程序相比， Java程序使用内存的情况更加糟糕。在Java中，对象被频繁创建，而直到所有到对象的引用都消失时，垃圾回收程序才会释放内存。即使运行了垃圾回收程序，也只会将内存还给虚拟机VM，而不是还给操作系统。结果是：Java程序会用光给它们的所有堆，从不释放。由于要保存实时（Just In Time，JIT）编译器产生的代码，Java程序的大小有时可能会膨胀为最大堆的数倍之巨。
还有一个问题，情况与此类似。从连接池分配一个数据库连接，而无法将已分配的连接还回给连接池。一些连接池有活动计时器，在维持一段时间的静止状态之后，计时器会释放掉数据库连接，但这不足以缓解糟糕的代码快速泄漏数据库连接所造成的资源浪费。
进程缺乏文件描述符
如果已为一台Web服务器或其他关键进程分配了文件描述符，但它却需要更多的文件描述符，则服务器或进程会被挂起或报错，直至得到了所需的文件描述符为止。文件描述符用来保持对开放文件和开放套接字的跟踪记录，开放文件和开放套接字是Web服务器很关键的组成部分，其任务是将文件复制到网络连接。默认时，大多数shell有64个文件描述符，这意味着每个从shell启动的进程可以同时打开64个文件和网络连接。大多数shell都有一个内嵌的 ulimit命令可以增加文件描述符的数目。
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