同厂商之间的互操作
对于开源软件发布商来说，为了向市场销售产品，售前需取得众多配套的硬件厂商(IHVs)、软件厂商(ISVs)、系统集成厂商(SIs)的支持，进行产品配套的兼容性测试和质量认证，从而实现不同厂商不同产品相互间的互操作。
2006年，国内Linux品牌与Dell、HP、TCL、华硕、神州数码、同方、七喜等PC厂商签订600多万套预装协议(联想、方正也正在对不同的Linux发布版进行配套选型);IBM为中科红旗的服务器Linux操作系统进行质量认证测试工作(这是IBM继Red Hat、Novell之后为全球第三家Linux发布商进行质量认证测试)。从而使开源企业与其相应的配套企业实行了不同产品之间的兼容性(互操作性)。
2006年微软和其他25家软件与硬件厂商组建“互操作厂商联盟(IVA，Interoperability Vendors Alliance)”, 目的是确保这些厂商提供的产品和服务能与微软的Windows操作系统和应用产品实行互操作，在这些厂商中，如Novell、Sun、Sugar CRM、Xen Source、JBOSS和Red Hat等均为开源企业。
Spike Source等多家开源软件公司也联手组建“开放解决方案联盟(OSA，Open Solutions Alliance)”，以确保他们产品之间能够互操作.
标准的互操作
制定、执行开放的国际标准，为互操作性提供基础。
设计转换器/翻译器(Converter/Translator),实现不同标准之间的互操作。例如，ISO已批准“开放文档格式(ODF)”为国际标准，它与微软的“Office Open XML文档格式”不兼容[微软的Office Open XML文档格式在取得欧洲计算机制造联合会(Ecma International, 这是一家国际标准咨询机构)认可的基础上，也正在向ISO申报要求成为国际标准]，微软支持Aztec Soft公司(法国)开发转换器，以间接支持ODF。又如，Novell宣布:与微软合作，在Novell版的Open Office中支持Office Open XML格式，并表示联合设计翻译器(Translator)，以使Novell版的Open Office与微软的Office 2007实现互操作。
在虚拟化环境中，共存就体现执行不同标准虚拟应用的互操作。
国内“统一办公文档标准(UOF，Uniformed Office Format)”计划申报要求批准为国家标准，有人认为，UOF具有中国文档特色，但要形成标准必须与ODF一致或能互操作，有人作了调查，UOF的约70%的条款是与ODF一致的，20%的条款是可用转换器与ODF实行互操作的，10%的条款是既不一致也不能采用转换器来进行互操作的。这里的关键是要处理好这个10%。
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