进程管理及调度：Linux开销较小
在进程管理及调度方面，Linux是一个单块式的操作系统，操作系统通常在用户进程的内存空间内进行，可免去发生系统调用时的进程切换开销。Windows是一个准微内核操作系统，许多功能以单独的进程实现，从而提高了系统的模块化程度，但进程切换上的开销要大一些。
Linux支持内核级的线程，但它将线程定义为进程的另一个“执行上下文”，从而简化了进程/线程之间的关系和调度程序的设计，它的线程库提供了和POSIX兼容的线程同步机制。Windows支持的线程是典型的进程/线程模型。它的线程同步机制和Linux类似。Linux中进程是基本的调度单位，它提供了三种调度策略。
进程间通信机制：Linux更灵活
在进程间通信机制上，Linux提供了标准的UNIX IPC机制，而Windows 则在基本IPC机制的基础上，提供了许多直接面向应用程序的高级IPC机制。从本质上看，Linux的IPC机制接近于IPC原语，比较底层，提供了最大的灵活性，也可以在此基础上建立更加复杂的高级IPC机制，而Windows 在原语级提供的IPC机制有管道、命名管道、消息传递、共享内存、信号量等。
内存管理：Linux优于Windows
在内存管理上，Linux 和Windows 在面对相同的进程地址空间大小时，对内存布局的使用方式不同。Windows实际只为进程准备了2GB弱的可用虚拟地址空间，而Linux中的进程地址空间使用更灵活些。
在虚拟内存的使用上，Linux内核为用户管理了非常多的细节问题，用户可以认为自己真正拥有4GB地址空间，而不用关心虚拟内存是否提交物理存储等问题。Windows为程序员提供了多种虚拟内存使用方案，虽然这些方案的使用有些复杂，但却提供了一定程度上的灵活性。它也支持DOS和Win16程序的执行，但为了提供这种兼容性，它的内存管理付出了极高的性能代价。
Linux 和Windows虽然均提供了内存共享技术，但它们的实现有些细微的差别。Linux提供给用户的接口非常简单，只需将自己的虚拟内存空间区域附加到共享内存对象之上。Windows则是通过内存映射文件提供共享内存机制，从使用上讲，略显复杂。
Linux的内存交换管理灵活性很强，用户可以在普通的文件系统上建立“无洞”的文件作为交换空间，还可以使用多个交换文件，从而可以动态增加交换文件。它也提供了利用交换分区作为交换空间的方法，此方法是优选的交换空间方案。Windows 的页面文件很难摆脱碎片化的危险，为了保证它采用无碎片的页面文件，必须采取一定的措施。
Linux 和Windows 在高速缓存的使用上有一些共同之处，均尽量采用系统的全部空闲RAM作为高速缓存区域，但Linux在高速缓存管理上有一些独到之处，这是它性能之所以高的根本原因所在。
安全性：Linux具有一定优势
在安全性方面，Linux采用的是UNIX在安全性方面成功的技术，尽管有一些安全漏洞，但因为设计上的开放性，这些漏洞能够在很快的时间内发现并得到解决。Windows 虽然采用的ACL技术，更加复杂和严密，但因为其密码加密步骤过于简单，密码容易被破解。安全性设计上的不公开性也导致其有很多安全上的漏洞。
一项最新的测试结果表明，采用linux下的samba文件服务器与windows 2003 server文件服务器性能比较，linux的表现是非常令人满意的。
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